Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EP300Q09472 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EP300Q09472 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EP300Q09472 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EP300Q09472 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms