Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FMODQ06828 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FMODQ06828 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FMODQ06828 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FMODQ06828 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
FMODQ06828 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms