Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms