Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms