Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F1Q03052 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms