Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms