Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms