Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms