Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms