Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms