Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms