Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG7P83436 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG7P83436 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms