Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN10P78369 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms