Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HBA1P69905 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBA1P69905 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBA1P69905 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HBA1P69905 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HBA1P69905 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HBA1P69905 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HBA1P69905 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HBA1P69905 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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