Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms