Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB15P59190 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB15P59190 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB15P59190 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB15P59190 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms