Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX16P57768 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX16P57768 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX16P57768 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX16P57768 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX16P57768 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX16P57768 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX16P57768 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms