Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPTEP56180 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPTEP56180 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms