Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPAP49450 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms