Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms