Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIP4K2AP48426 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms