Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSFMP43897 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSFMP43897 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSFMP43897 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSFMP43897 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSFMP43897 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSFMP43897 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSFMP43897 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSFMP43897 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSFMP43897 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSFMP43897 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSFMP43897 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSFMP43897 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSFMP43897 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSFMP43897 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSFMP43897 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSFMP43897 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms