Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDF5P43026 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDF5P43026 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDF5P43026 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF5P43026 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms