Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETFBP38117 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETFBP38117 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ETFBP38117 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETFBP38117 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETFBP38117 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETFBP38117 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETFBP38117 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETFBP38117 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ETFBP38117 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms