Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP1P29466 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms