Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HRCP23327 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HRCP23327 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HRCP23327 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HRCP23327 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HRCP23327 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms