Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms