Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms