Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSPP15924 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms