Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms