Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms