Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms