Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX3O95343 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX3O95343 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX3O95343 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX3O95343 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX3O95343 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX3O95343 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX3O95343 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX3O95343 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX3O95343 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX3O95343 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX3O95343 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX3O95343 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX3O95343 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX3O95343 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX3O95343 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX3O95343 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIX3O95343 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIX3O95343 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX3O95343 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX3O95343 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX3O95343 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms