Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms