Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPLO60437 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPLO60437 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPLO60437 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms