Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOCS6O14544 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms