Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms