Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA3Q9Y6Q9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCOA3Q9Y6Q9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCOA3Q9Y6Q9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NCOA3Q9Y6Q9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms