Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF19Q9UMS4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms