Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNAL1Q9UBT7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms