Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLCO1C1Q9NYB5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1C1Q9NYB5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms