Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ERVK13-1Q9NX77 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK13-1Q9NX77 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms