Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.151e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 FNBP4-214ENST00000540172 582 ntTSL 314.84□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 PRPF40A-201ENST00000354363 1622 ntTSL 214.38□□□□□ -0.111e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 PRPF40A-211ENST00000493468 1043 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.181e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 PRPF40A-203ENST00000448428 490 ntTSL 512.82□□□□□ -0.361e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 CLASRP-207ENST00000587112 867 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.396e-10■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 SERBP1-207ENST00000490406 624 ntTSL 511.96□□□□□ -0.491e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 SARNP-201ENST00000336133 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 CENPC-205ENST00000510189 2917 ntTSL 1 (best)11.35□□□□□ -0.591e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 CLASRP-213ENST00000591410 572 ntTSL 411.06□□□□□ -0.646e-10■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 SARNP-202ENST00000546604 1163 ntTSL 211.02□□□□□ -0.651e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-207ENST00000536606 572 ntTSL 39.57□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-204ENST00000464211 562 ntTSL 58.55□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.131e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 SARNP-205ENST00000552884 997 ntTSL 1 (best)6.99□□□□□ -1.291e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-203ENST00000448750 2455 ntTSL 26.69□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 PRPF40A-210ENST00000489741 776 ntTSL 36.26□□□□□ -1.411e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 UBAP2L-213ENST00000466173 804 ntTSL 25.19□□□□□ -1.581e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 TRIM24-205ENST00000493595 811 ntTSL 34.97□□□□□ -1.611e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-209ENST00000539498 1659 ntTSL 24.35□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 RAN-206ENST00000535090 657 ntTSL 54.06□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 CENPC-202ENST00000506410 692 ntTSL 23.4□□□□□ -1.871e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.91e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 PSMD14-203ENST00000477232 4890 ntTSL 1 (best)2.23□□□□□ -2.051e-9■■■■■ 40.4
RBM22Q9NW64 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.978e-8■■■■■ 40.3
RBM22Q9NW64 SLC38A2-210ENST00000551405 526 ntTSL 415.94■□□□□ 0.146e-16■■■■■ 40.3
RBM22Q9NW64 ZNF800-204ENST00000434602 955 ntTSL 510.7□□□□□ -0.78e-8■■■■■ 40.3
RBM22Q9NW64 ZNF800-205ENST00000436992 502 ntTSL 20.81□□□□□ -2.288e-8■■■■■ 40.3
RBM22Q9NW64 NKTR-205ENST00000459950 2134 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 40.3
RBM22Q9NW64 NKTR-207ENST00000460910 282 ntTSL 518.32■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 40.3
RBM22Q9NW64 HSP90B1-202ENST00000540297 590 ntTSL 320.03■□□□□ 0.88e-7■■■■■ 40.2
RBM22Q9NW64 HSP90B1-205ENST00000549334 581 ntTSL 417.36■□□□□ 0.378e-7■■■■■ 40.2
RBM22Q9NW64 USP15-206ENST00000546718 559 ntTSL 214.24□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 40.2
RBM22Q9NW64 USP15-217ENST00000551206 1022 ntTSL 213.15□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 40.2
RBM22Q9NW64 USP15-204ENST00000537297 579 ntTSL 210.55□□□□□ -0.728e-7■■■■■ 40.2
RBM22Q9NW64 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.229e-31■■■■■ 40.2
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RBM22Q9NW64 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 318.83■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 40
RBM22Q9NW64 MED15-221ENST00000473028 556 ntTSL 417.73■□□□□ 0.433e-10■■■■■ 40
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RBM22Q9NW64 MED15-206ENST00000420849 430 ntTSL 316.12■□□□□ 0.173e-10■■■■■ 40
RBM22Q9NW64 MED15-216ENST00000445189 596 ntTSL 416.12■□□□□ 0.173e-10■■■■■ 40
RBM22Q9NW64 MED15-217ENST00000445987 590 ntTSL 416.06■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 40
RBM22Q9NW64 MED15-219ENST00000457322 623 ntTSL 416.06■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 40
RBM22Q9NW64 MED15-228ENST00000487550 587 ntTSL 315.43■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 40
RBM22Q9NW64 MED15-209ENST00000428629 572 ntTSL 49.19□□□□□ -0.943e-10■■■■■ 40
RBM22Q9NW64 HGS-217ENST00000577012 716 ntTSL 521.05■□□□□ 0.965e-9■■■■■ 40
RBM22Q9NW64 HGS-215ENST00000576393 922 ntTSL 220.75■□□□□ 0.915e-9■■■■■ 40
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RBM22Q9NW64 HGS-216ENST00000576498 1004 ntTSL 218.07■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 40
RBM22Q9NW64 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.355e-9■■■■■ 40
RBM22Q9NW64 HGS-208ENST00000572392 824 ntTSL 515.93■□□□□ 0.145e-9■■■■■ 40
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RBM22Q9NW64 U2AF2-204ENST00000587275 554 ntTSL 419.97■□□□□ 0.793e-9■■■■■ 39.9
RBM22Q9NW64 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.365e-9■■■■■ 39.9
RBM22Q9NW64 CFB-278ENST00000472581 1059 ntTSL 215.69■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 39.9
RBM22Q9NW64 CFB-279ENST00000475617 586 ntTSL 47.54□□□□□ -1.25e-6■■■■■ 39.9
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RBM22Q9NW64 RAB27A-206ENST00000565776 567 ntTSL 422.67■■□□□ 1.223e-8■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 RAB27A-204ENST00000563262 702 ntTSL 310.48□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.273e-8■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 RAB27A-207ENST00000565972 809 ntTSL 35.66□□□□□ -1.53e-8■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 RAB27A-211ENST00000568803 432 ntTSL 35.08□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 RAB27A-209ENST00000567380 701 ntTSL 31.66□□□□□ -2.143e-8■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 PABPC4-215ENST00000484555 450 ntTSL 512.19□□□□□ -0.464e-14■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.099e-7■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 09e-7■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-217ENST00000557543 2020 ntTSL 218.95■□□□□ 0.622e-27■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-207ENST00000553482 595 ntTSL 318.89■□□□□ 0.612e-27■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.582e-27■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-27■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.542e-27■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-212ENST00000556214 579 ntTSL 217.97■□□□□ 0.472e-27■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.422e-27■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.422e-27■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-27■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-213ENST00000556465 220 ntTSL 315.86■□□□□ 0.132e-27■■■■■ 39.8
RBM22Q9NW64 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.042e-27■■■■■ 39.8
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