Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC24

TMBIM4, Protein lifeguard 4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM4Q9HC24 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMBIM4Q9HC24 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMBIM4Q9HC24 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMBIM4Q9HC24 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMBIM4Q9HC24 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms