Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 MLLT10-214ENST00000480415 297 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 MLLT10-213ENST00000479634 165 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 MLLT10-209ENST00000462999 344 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 SRRT-213ENST00000611405 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 DNMT1-211ENST00000586988 711 ntTSL 513.39□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 AC099811.2-202ENST00000592248 694 ntTSL 312.17□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 KANK1-210ENST00000619269 5688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 KANK1-209ENST00000489369 7193 ntTSL 511.09□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 AC099811.2-201ENST00000585562 646 ntTSL 310.27□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 KANK1-201ENST00000354485 6912 ntTSL 29.1□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 MLLT10-212ENST00000476557 490 ntTSL 1 (best)7.43□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.518e-9■■■■□ 19.3
FTOQ9C0B1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.42e-6■■■□□ 19.1
FTOQ9C0B1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.395e-8■■■□□ 19.1
FTOQ9C0B1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.385e-8■■■□□ 19.1
FTOQ9C0B1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.345e-8■■■□□ 19.1
FTOQ9C0B1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.345e-8■■■□□ 19.1
FTOQ9C0B1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.345e-8■■■□□ 19.1
FTOQ9C0B1 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.25e-8■■■□□ 19.1
FTOQ9C0B1 MLXIPL-209ENST00000467221 774 ntTSL 512.54□□□□□ -0.45e-8■■■□□ 19.1
FTOQ9C0B1 CANX-218ENST00000514032 1876 ntTSL 224.03■■□□□ 1.447e-22■■■□□ 19
FTOQ9C0B1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.467e-22■■■□□ 19
FTOQ9C0B1 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.147e-22■■■□□ 19
FTOQ9C0B1 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.077e-22■■■□□ 19
FTOQ9C0B1 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 425.18■■□□□ 1.626e-6■■■□□ 19
FTOQ9C0B1 CXXC5-206ENST00000504844 777 ntTSL 224.39■■□□□ 1.496e-6■■■□□ 19
FTOQ9C0B1 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 524.75■■□□□ 1.557e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.077e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.127e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.93e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 GNPTG-205ENST00000527168 1317 ntTSL 526.23■■□□□ 1.793e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 GNPTG-208ENST00000529957 922 ntTSL 525.59■■□□□ 1.693e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 GNPTG-209ENST00000534197 420 ntTSL 325.59■■□□□ 1.693e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 GNPTG-206ENST00000527876 550 ntTSL 425.29■■□□□ 1.643e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 GNPTG-207ENST00000529110 552 ntTSL 225.11■■□□□ 1.613e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 GNPTG-202ENST00000526820 572 ntTSL 322.23■■□□□ 1.153e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.093e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.063e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.043e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 AHCTF1-205ENST00000478568 611 ntTSL 419.07■□□□□ 0.643e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.583e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.163e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.213e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 330.45■■■□□ 2.471e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.091e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 326.56■■□□□ 1.841e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 525.67■■□□□ 1.71e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.571e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.541e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 524.56■■□□□ 1.521e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 424.56■■□□□ 1.521e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 324.07■■□□□ 1.441e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-211ENST00000466752 886 ntTSL 321.71■■□□□ 1.071e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-217ENST00000491779 611 ntTSL 221.71■■□□□ 1.071e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 321.51■■□□□ 1.031e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.951e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.761e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-218ENST00000502382 530 ntTSL 418.45■□□□□ 0.541e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 UBE2J2-215ENST00000477894 767 ntTSL 518.08■□□□□ 0.481e-7■■■□□ 18.9
FTOQ9C0B1 FLOT2-208ENST00000582174 703 ntTSL 322.18■■□□□ 1.141e-6■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 FLOT2-212ENST00000593158 752 ntTSL 521.11■□□□□ 0.971e-6■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 FLOT2-206ENST00000580805 2679 ntTSL 519.38■□□□□ 0.691e-6■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 FLOT2-204ENST00000577789 2503 ntTSL 519.31■□□□□ 0.681e-6■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 FLOT2-211ENST00000586827 1069 ntTSL 513.97□□□□□ -0.171e-6■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.121e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 PPM1B-203ENST00000378540 1703 ntTSL 226.7■■□□□ 1.861e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 PPM1B-208ENST00000419807 2084 ntTSL 525.59■■□□□ 1.691e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.211e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 PPM1B-207ENST00000409486 1481 ntTSL 1 (best)21.54■■□□□ 1.041e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.51e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 COPB2-212ENST00000514508 635 ntTSL 413.94□□□□□ -0.181e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 COPB2-211ENST00000513274 729 ntTSL 313.39□□□□□ -0.271e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 COPB2-208ENST00000512153 629 ntTSL 412.81□□□□□ -0.361e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 COPB2-209ENST00000512242 848 ntTSL 512.64□□□□□ -0.391e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 COPB2-207ENST00000510491 669 ntTSL 511.27□□□□□ -0.611e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 COPB2-206ENST00000510181 1037 ntTSL 28.71□□□□□ -1.021e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 COPB2-204ENST00000504295 3524 ntTSL 27.47□□□□□ -1.211e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 COPB2-213ENST00000515006 548 ntTSL 56.74□□□□□ -1.331e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.371e-7■■■□□ 18.7
FTOQ9C0B1 NMT1-208ENST00000588975 183 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.364e-13■■■□□ 18.6
FTOQ9C0B1 NMT1-209ENST00000590114 666 ntTSL 315.1■□□□□ 0.014e-13■■■□□ 18.6
FTOQ9C0B1 NMT1-203ENST00000585561 807 ntTSL 315.1■□□□□ 0.014e-13■■■□□ 18.6
FTOQ9C0B1 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.174e-13■■■□□ 18.6
FTOQ9C0B1 NMT1-202ENST00000543908 1066 ntTSL 213.86□□□□□ -0.194e-13■■■□□ 18.6
FTOQ9C0B1 NMT1-201ENST00000258960 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.614e-13■■■□□ 18.6
FTOQ9C0B1 NMT1-212ENST00000592654 558 ntTSL 48.64□□□□□ -1.034e-13■■■□□ 18.6
FTOQ9C0B1 EIF3B-203ENST00000413917 962 ntTSL 222.84■■□□□ 1.255e-13■■■□□ 18.6
FTOQ9C0B1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.225e-13■■■□□ 18.6
FTOQ9C0B1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.035e-13■■■□□ 18.6
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