Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SRRTQ9BXP5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRRTQ9BXP5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms