Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD7Q9BUK0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD7Q9BUK0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD7Q9BUK0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD7Q9BUK0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD7Q9BUK0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD7Q9BUK0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD7Q9BUK0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD7Q9BUK0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD7Q9BUK0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHCHD7Q9BUK0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD7Q9BUK0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms