Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIKE1Q9BRV8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms