Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHOX2BQ99453 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms