Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSL1Q96IY1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms